Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18Q15532 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18Q15532 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18Q15532 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms