Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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