Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHPRHQ149N8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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