Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPNMBQ14956 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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