Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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GBX1Q14549 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX1Q14549 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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