Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX2Q13950 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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