Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PKD2Q13563 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
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