Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC1Q13547 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC1Q13547 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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