Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRQ13535 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRQ13535 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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