Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SCGB2A2Q13296 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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SCGB2A2Q13296 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SCGB2A2Q13296 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SCGB2A2Q13296 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SCGB2A2Q13296 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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