Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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NPRL3Q12980 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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NPRL3Q12980 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPRL3Q12980 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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