Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4Q12950 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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