Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-6■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 27.36□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 411.23□□□□□ -0.615e-8■■■□□ 17.7
ILF3Q12906 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 47.82□□□□□ -1.165e-8■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.742e-7■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 TSSC2-203ENST00000526488 674 ntTSL 312.06□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 17.7
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ILF3Q12906 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.469e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.929e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.159e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.399e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.49e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.429e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 25.05□□□□□ -1.69e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.619e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.849e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 33.54□□□□□ -1.849e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.889e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.99e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.235e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 512.5□□□□□ -0.415e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.295e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 522.49■■□□□ 1.191e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.791e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 APOH-202ENST00000577982 707 ntTSL 54.24□□□□□ -1.734e-17■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-7■■■□□ 17.6
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