Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CGNL1Q0VF96 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CGNL1Q0VF96 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms