Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms