Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCBP1Q09161 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP1Q09161 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms