Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms