Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
APLP2Q06481 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APLP2Q06481 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms