Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms