Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLE4Q04727 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms