Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLH2Q02577 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms