Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DSG1Q02413 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms