Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5Q00535 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5Q00535 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms