Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNB1P98172 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms