Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P61576 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms