Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms