Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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