Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSDMDP57764 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms