Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMTNP53814 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms