Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms