Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGDP52209 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGDP52209 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGDP52209 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGDP52209 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGDP52209 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PGDP52209 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGDP52209 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGDP52209 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms