Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC3P51654 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC3P51654 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC3P51654 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC3P51654 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms