Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PAPOLAP51003 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAPOLAP51003 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms