Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms