Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTDSS1P48651 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTDSS1P48651 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms