Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms