Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms