Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms