Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB2P29033 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB2P29033 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB2P29033 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB2P29033 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms