Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO1P25800 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO1P25800 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms