Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA6P23229 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms