Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms