Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5AP20339 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB5AP20339 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB5AP20339 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB5AP20339 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RAB5AP20339 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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