Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRG2P13727 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRG2P13727 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRG2P13727 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms