Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LYL1P12980 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LYL1P12980 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LYL1P12980 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms