Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms