Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC192P0DO97 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC192P0DO97 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms