Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IL3P08700 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL3P08700 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL3P08700 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL3P08700 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL3P08700 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL3P08700 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3P08700 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3P08700 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3P08700 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3P08700 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms