Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV3-11P04433 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV3-11P04433 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV3-11P04433 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV3-11P04433 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV3-11P04433 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV3-11P04433 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms