Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA1P01562 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms